国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所
国立大学法人 大阪大学 蛋白質研究所

ダイナミクスを考慮した膜蛋白質の構造モデリング

概要

  • バイオインフォマティクスと分子シミュレーションの最新技術を結合し、以下の目的の達成を目的とした研究を行っています。
  1. 脂質二重膜中での膜タンパク質の構造安定化機構の解明
  2. 動的で大規模な構造変化を起こしやすい領域の予測とそれを考慮したモデリング技術の確立
  3. 膜タンパク質複合体の立体構造モデリングへの具体的応用

外部資金

最近の成果

文献

  1. Ahmad S., Singh YH., Paudel Y., Mori T., Sugita Y., Mizuguchi K., Integrated prediction of one-dimensional structural features and their relationships with conformational flexibility in helical membrane proteins, BMC Bioinformatics, 11:533, 2010 PubMed

共同研究者

  • 杉田有治(理研)
  • 岡本祐幸(名古屋大)
  • 森博幸(京大)